El Centro de Ecología Aplicada y Sustentabilidad –CAPES- realiza investigación aplicada en temas ambientales imperantes para el desarrollo sostenible de Chile, en el contexto internacional de las normas de la OCDE y los acuerdos internacionales de libre comercio.
Sus principales líneas de investigación son la remediación de metales pesados en medioambiente, la microbiología ambiental, la fisiología de la conservación y adaptación al cambio climático, la dinámica poblacional y explotación de recursos, y la gestión y manejo de recursos naturales en sistemas socioecológicos.
Sus principales fortalezas son la investigación de vanguardia del medio ambiente, la formación de capital humano avanzado, las actividades de transferencia/capacidades (conocimientos y tecnológica), fuertes alianzas con el sector privado, y la extensión y recaudación de fondos tanto nacionales como internacionales.